یافتن نواحی اگزونیک بر روی دنباله dna با استفاده از تکنیک های dsp

یکی از زمینه های تحقیقاتی که با سرعت زیادی رو به پیشرفت می باشد مطالعه بر روی ساختار dna می باشد. که هر روزه دست یافته های جدیدی به این زمینه اضافه می شود. دنباله dnaهر موجود زنده حاوری کلیه اطلاعات ژنتیکی موجودات زنده جهت انتقال خصوصیات یک نسل به نسل بعد می باشد وقتی دنباله dnaیک موجود زنده جدید بدست می اید مرحله بعد یافتن منطقه اگزون ها بر روی دنباله dnaمی باشد. کل دنبالهdnaاز دو رشته طولانی مارپیچ که از تکرار واحدهای ساختاری از جنس نوکلیوتید تشکیل شده است. نوکلیوتیدها از لحاظ ترکیبی چهار گونه متفاوت می باشند که با حروف الفبای c,t,a و g نشان می دهند. دنباله dnaبه نواحی ژنی و بین ژنی تقسیم می شود. که نوکلیوتیدهای تشکیل دهند ه نواحی ژنی کدهای سازنده پروتیین می باشند. ولی نقش نوکلیوتیدهای موجود در نواحی بین ژنی اتصال نواحی ژنی کدهای سازنده پروتیین می باشند ولی نقش نوکلیوتیدهای موجود در نواحی بین ژنی اتصال نواحی ژنی در سرتاسر دنباله dnaمی باشد. در موجودات یوکاریوتیک، ژن خود نیز به دو ناحیه اگزون و اینترون تفکیک می شود. در نواحی ژنی این موجودات نوکلیوتیدهای موجود در نواحی اینترون هیچ نقشی در ساخت پروتیین ندارند. از آنجا که تمام مشخصات وارثتی توسط dnaمنتقل می شود و نیز تمامی مشخصات فیزیولوژیکی و ظاهری نیز توسط dna کنترل می شود لذا پیدا کردن مکان هایی از dna که این اطلاعات مهم را در بر دارند (اگزون ) کمک بسیار زیادی در شناسایی بیماری ها(خصوصا بیماریهای وراثتی که ممکن است در آینده برای فرد رخ دهد) و شناسایی افرارد و dna به ما می کند. شناسایی نواحی اگزون ها را اصطلاحا به عنوان ژن یابی شناخته می شود. استفاده از تکنیک های پردازش سیگنال مبتنی بر مشخصه تناوب سه یکی از روش های جدید و در حال پیشرفت برای شناسایی نواحی اگزون ها می باشد. با وجود روش های متفاوت برای یافتن مکان اگزون ها هنوز دقت این روش ها به اندازه کافی نیست و نیاز به بهبود دارد. در این پایان نامه دو الگوریتم برای یافتن مکان اگزون ها با استفاده از تکینک پردازش سیگنال دیجیتال ارایه شده است. الگوریتم اول بر مبنای هبستگی متقاطع می باشد و الگوریتم دوم بر مبنای تبدیل ویولت پیوسته می باشد. شناسایی مناطق اگزونیک با استفاده از این دو الگوریتم به ترتیب هشت و شانزده درصد افزایش یافت.